人们可以在一种新的分析血液蛋白的方法的帮助下,尽早开始接受癌症和其他疾病的救命治疗
最近,研究人员发表了一篇论文,描述了一种新的方法来制备和分析血液样本,这大大提高了研究人员检测浓度非常低的蛋白质的能力,这种能力每毫升血液只有10微克。但这种微小、难以检测的浓度与疾病指示蛋白却有关系,它也被称为生物标志物。
许多研究人员通过使用抗体、y型蛋白质来识别蛋白质,这些蛋白质会抓住他们专门设计的蛋白质。但许多蛋白质要么没有匹配的抗体,要么它们的抗体不够好。
长期以来,研究人员一直使用这种抗体,但质谱技术提供了一种有吸引力的替代方法,可以更有效地识别蛋白质。为了分析血液或其他生物样本中给定的蛋白质,研究人员使用了一种叫做“选择性反应监测”的质谱方法,也叫SRM。SRM特别寻找有靶向蛋白存在的独特肽。
2012年,PNNL的科学家们在标准SRM上进行了改进,他们开发了一种名为“棱镜- SRM”的新方法,该方法将样本分为96个部分,并确定哪些部分含有目标蛋白。这使研究人员能够通过质谱计,在更有针对性的蛋白质上运行丰富的样本。因此,它可以检测出血液中每毫升血液中存在浓度在1毫微克到100微克的蛋白质。当与疾病无关的普通蛋白质通过一种被称为“耗尽”的过程被移除,当普通蛋白质没有被耗尽时,就会发生1纳米级的敏感性。
但他们仍然希望检测出更多的蛋白质。为了在质谱仪中使用更多的所需蛋白质样本,由陶刘领导的一组PNNL研究人员创建了一个新的过程,开始时大量的样本数量。在将最初的样本切割成96个分数之后,科学家们将其与以PRISM为目标的靶点蛋白质分离。接下来,他们将这个分数分离成另一个96,再一次将含有感兴趣的蛋白质的分数分离出来。
这种新方法被称为“深海潜射”,它可以使原本血液样本中含有的蛋白质达到每毫升10微克,而不需要抗体或前期消耗。与传统的SRM分析相比,这种方法的灵敏度提高了大约10万倍,而与prismsrm相比,则提高了大约100倍。
在任何生物或临床样本中,研究人员都可以利用深层SRM来识别疾病指示蛋白,在它们变得更丰富之前,包括可能诊断肿瘤之前的癌症。这样的早期发现可以增加挽救病人生命的机会。